PHYSiologie des microALGues (PHYSALG)

Le laboratoire PHYSiologie des microALGues (PHYSALG) vise à caractériser les réponses physiologiques des Microalgues Toxiques et Nuisibles face à leur environnement.

PHYSALG concourt au projet de recherche de l’unité PHYTOX à travers ses compétences spécifiques, qui recouvrent les champs des cultures contrôlées, de la caractérisation physiologique (photosynthèse et nutrition) et de la modélisation métabolique et phénoménologique des microalgues toxiques et nuisibles. S’y ajoutent des compétences en isolement de souches et un savoir-faire rare sur la culture de la chaine trophique de Dinophysis.

L’objectif de PHYSALG est (1) de garantir des conditions expérimentales parfaitement caractérisées, pour (2) mesurer les réponses physiologiques d’acclimatation et d’adaptation des microalgues aux forçages de l’environnement, et (3) en définir les traits physiologiques et les caractéristiques phénotypiques. La synergie avec les deux autres laboratoires de l’unité - GENALG et METALG - propose une approche multidisciplinaire cohérente des questions étudiées à l’échelle de l’unité PHYTOX.

Le laboratoire développe ses propres dispositifs expérimentaux de culture contrôlée. Il est également doté d’équipements de production, de volume supérieur, pour subvenir aux besoins analytiques de l’unité.

Il est dirigé par Gaël BOUGARAN, et est situé sur le Centre Ifremer Atlantique à Nantes.

Le personnel

> permanent

  • BERARD Jean Baptiste, ingénieur (écophysiologie, systèmes de culture expérimentale, valorisation des molécules en santé)
  • BOUGARAN Gaël, responsable du laboratoire, cadre de recherche (écophysiologie, nutrition minérale et mixotrophie, amélioration d'espèce, valorisation)
  • CARPENTIER Liliane, ingénieur (écophysiologie, culture dinoflagellés)
  • CARUANA Amandine, cadre de recherche (écophysiologie des microalgues toxiques, dinoflagellés, diatomées, DMSP, changement global)
  • CHARRIER Aurélie, technicienne (écophysiologie, expérimentations en cultures contrôlées, analyses biochimiques)
  • EVRARD Elise, technicienne (écophysiologie, expérimentations en cultures contrôlées, analyses biochimiques)
  • GOUHIER Lena, technicienne (souchothèque et production de biomasses)
  • LACOUR Thomas, cadre de recherche (écophysiologie, photosynthèse, régulation énergétique, mixotrophie)
  • MAIRET Francis, cadre de recherche (modélisation, réseau métabolique, biologie des systèmes, mixotrophie)
  • RAIMBAULT Virginie, technicienne (écophysiologie, expérimentations en cultures contrôlées, analyses biochimiques)
  • STACHOWSKI-HABERKORN Sabine, cadre de recherche (écophysiologie, cytométrie en flux)
  • SECHET Véronique, cadre de recherche  (biologie, cultures dinoflagellés, écophysiologie et production toxines, mixotrophie)

> non permanent

  • BOUCHER Clémence. Doctorante du 04/10/21 au 03/10/24.  Sujet : Bi-modal mixotrophy in harmful microalgae.
  • POCHIC Victor. Accueil du 12/09/22 au 31/10/23, en CDD Nantes Université.
  • CITAKOVIC Ivan. Doctorant du 22/03/23 au 21/03/26. Sujet :  Amélioration par mutagenèse aléatoire de la productivité en Amphidinol 18 chez la microalgue dinoflagellée Amphidinium carterae.

Equipements

Culture expérimentale
  • Plateau expérimental de photobioréacteurs automatisés pour la culture en continu : équipé de photobioréacteurs de diverses géométries (plane, cylindrique et tubulaire), de volumes compris entre 1 et 100 L, stérilisables chimiquement ou autoclavables
  • Banc de phénotypage : 24 photobioréacteurs autoclavables sous conditions homogènes de lumière, température et pH
  • TIP, dispositif expérimental pour les approches en plans factoriels : 17 photobioréacteurs en conditions de lumière, température et pH paramétrables
  • Enceintes de culture : 8 enceintes thermo-régulées Binder, Strader, Gorenge
Production
  • Photobioréacteurs de production : volumes variables de 17 à 120 L, de géométrie cylindrique ou tubulaire (différents bioréacteurs à PHYC et PBA)
  • Récolte de microalgues : centrifugeuse à assiettes GEA OTC2
 Suivi de cultures et de caractérisation physiologique
  • Microscopie : inversée Olympus CK2, Olympus IMT2 et Zeiss IM35 ; à fluorescence Zeiss Axio 5 ; droite Leitz Dialux 20
  • Dénombrement cellulaire : Coulter Counter et station d’analyse d’images
  • Cytométrie en flux : Miltenyi MACS Quant 10, 3 lasers ; BD / ACCURI, 2 lasers (partagé multi-équipe)
  • Photosynthèse : Phytopam Walz et oxymètre Oxylab