METabolites des microALGues (METALG)

Le laboratoire METabolites des microALGues (METALG) étudie les métabolites algaux, leurs biotransformations et diversité.

Il est dirigé par Damien REVEILLON, et est situé sur le Centre Ifremer Atlantique à Nantes.

Le personnel

- permanent

  • AMZIL Zouher, cadre de recherche (Chimie analytique, algues toxiques, phycotoxines/cyanotoxines, risques émergents)
  • HERVE Fabienne, ingénieure (Chimie analytique, développement de méthodes, analyses LC-(HR)MS/MS, purification)
  • HUBERT Clarisse, technicienne (Chimie minérale, chimie analytique)
  • JARNOUX Nathalie, technicienne (Assistante de laboratoire)
  • LHAUTE Korian, technicien (Tests de cytotoxicité, analyses biochimiques, chimie analytique)
  • REVEILLON Damien, cadre de recherche (Chimie analytique, phycotoxines, métabolomique, chimiodiversité, écologie chimique), et responsable de laboratoire
  • SIBAT Manoëlla, ingénieure (Chimie analytique, phycotoxines, chimiodiversité, analyses LC-(HR)MS/MS, élucidation structurale)
  • SAVAR Véronique, technicienne (Chimie analytique, phycotoxines hydrophiles, développement de méthodes, analyses LC-MS/MS et LC-FLD, métrologie)
  • TANNIOU Simon, technicien (Chimie analytique, préparation d'échantillons, développement de méthodes, analyses LC-MS/MS)

- non permanent

  • PLESSIS Loïc, doctorant Yves Rocher en accueil à Phytox. Sujet : Identification de métabolites micro-algaux avec effets inflammatoires ou anti-inflammatoires et/ou oxydants ou anti-oxydants via des modèles cellulaires, biomoléculaires et protéomiques de la peau humaine

Les équipements

Chimie analytique
  • 2 systèmes UPLC-MS/MS (UFLC, Shimadzu – QTRAP4000, Sciex) : Spectromètres de masses hybrides triples quadripôles-pièges d’ions pour l’analyse ciblée/quantitative des métabolites d’intérêt (e.g toxines, osmolytes) et l’obtention de spectres de masses de basse résolution
  • UPLC-DAD-MS/MS (UFLC, Shimadzu – SPD-M20A, Shimadzu – QTRAP4000, Sciex)
  • UHPLC-MS/MS (Nexera, Shimadzu/µLC Eksigent  – QTRAP 5500, Sciex)
  • UHPLC-DAD-HRMS (1290 Infinity II, Agilent – 6550 ifunnel QTOF, Agilent) : spectromètre de masse de haute résolution pour l’analyse non-ciblée et l’obtention de spectres de masses (identification de métabolites, analyse métabolomique)
  • HPLC-DAD (Agilent 1200) pour l’analyse de pigments
  • GC-FID (GC Trace 1310, ThermoFisher) pour l’analyse des acides gras
Purification
  • Flash chromatography (Combi Flash RF, Serlabo)
  • Automate SPE (GX-271, Gilson)
  • HPLC (semi-préparative)-DAD-MS, avec collecteur de fractions (Agilent
Biochimie
  • Analyseur élémentaire (NC soil Flash 2000, Thermo) pour quotas azote et carbone
  • Auto-analyseur en flux (Module axflow AA3) pour analyse nutriments minéraux dissous (partagé LER-MPL)
Tests fonctionnels
  • Laboratoire complet (PSM, incubateur, lecteur de microplaque Bioscreen) pour réaliser des bioessais cellulaires (e.g. viabilité cellulaire) ou type fRBA (fluorescence Receptor Binding Assay). Utilisés pour criblage d’activité, notamment dans le cadre de fractionnement bioguidé